Нозокомиальная пневмония у взрослых: структура возбудителей и новые возможности этиологической диагностики


DOI: https://dx.doi.org/10.18565/pharmateca.2019.5.39-46

Ю.А. Янович (1), С.А. Рачина (1), М.В. Сухорукова (2), Ю.А. Савочкина (3), М.В. Вацик (4), А.А. Петров (4)

1) Российский университет дружбы народов, Москва, Россия; 2) Смоленский государственный медицинский университет, Смоленск, Россия; 3) Центр стратегического планирования и управления медико-биологическими рисками здоровью, Москва, Россия; 4) Городская клиническая больница им. В.В. Виноградова, Москва, Россия
Нозокомиальная пневмония (НП) – одна из наиболее частых инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи. Ввиду широкой распространенности поли-, экстремально- и панрезистентных бактерий существенную проблему представляет выбор режимов эмпирической антимикробной терапии НП. В статье освещены вопросы этиологической структуры НП у взрослых, представлены основные тенденции антибиотикорезистентности среди нозокомиальных патогенов в РФ, рассмотрены современные методы этиологической диагностики НП, включая перспективные направления, основанные на методах амплификации нуклеиновых кислот.
Ключевые слова: нозокомиальная пневмония, этиология, микробиологическая диагностика, молекулярные методы диагностики, антибиотикорезистентность

Литература


1. Нозокомиальная пневмония у взрослых. Российские национальные рекомендации. Под ред. Б.Р. Гельфанда, отв. ред. Д.Н. Проценко, Б.З. Белоцерковский. 2-е изд., перераб. и доп. М., 2016. 176 с.

2. Kollef M., Hamilton С., Ernst F. Economic impact of ventilator-associated pneumonia in large matched cohort. Infect Control Hosp Epidemiol. 2012;3:250–56. Doi: 10.1086/664049.

3. Melsen W.G., Rovers M.M., Koeman M., et al. Estimating the attributable mortality of ventilator-associated pneumonia from randomized prevention studies. Critical Care Med. 2011;39(12):2736–42. Doi: 10.1097/CCM.0b013e3182281f33.

4. Brito V., Niederman M.S. Healthcare-associated pneumonia is a heterogeneous disease, and all patients do not need the same broad-spectrum antibiotic therapy as complex nosocomial pneumonia. Curr Opin Inf Dis. 2009;22(3):316–25. Doi:10.1097/QCO.0b013e328329fa4e.

5. Torres A., Niederman M.S., Chastre J. International ERS/ESICM/ESCMID/ALAT guidelines for the management of hospital-acquired pneumonia and ventilator-associated pneumonia. Eur Respir J. 2017;50(3); pii:1700582. Doi: 10.1183/13993003.00582-2017.

6. Рачина С.А., Сухорукова М.В., Петров А.А. и др. Особенности этиологии и микробиологическая диагностика при нозокомиальной пневмонии у взрослых. Практическая пульмонология 2017;4:45–51.

7. Barbier F., Andremont A., Wolff M., et al. Hospital-acquired pneumonia and ventilator-associated pneumonia: recent advances in epidemiology and management.. Curr Opin Pulm. Med 2013;19:216–28. Doi: 10.1097/MCP.0b013e32835f27be.

8. Kalil A.C., Metersky M.L., Klompas M., et al. Management of Adults With Hospital-acquired and Ventilator-associated Pneumonia: 2016 Clinical Practice Guidelines by the Infectious Diseases Society of America and the American Thoracic Society. Clin Inf Dis. 2016;3(5):61–111.

9. Petrov A., Quintana W., Mosquera P., et al. Etiology of nosocomial pneumonia in multidisciplinary hospital. Eur Respir J. 2018;52:PA1963. Doi: 10.1183/13993003.congress-2018.PA1963.

10. Яковлев С.В., Суворова М.П., Белобородов В.Б.и др. Распространенность и клиническое значение нозокомиальных инфекций в лечебных учреждениях России: исследование ЭРГИНИ. Антибиотики и химиотерапия 2016;61(5–6):32–42.

11. Диагностика и лечение микозов в отделениях реанимации и интенсивной терапии. Pоссийские рекомендации. Отв. ред.Н.Н. Климко. 2-е изд., перераб. и доп. М., 2015. 96 с.

12. Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю. и др. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Enterobacteriaceae в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН-2013–2014. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия 2017;19(1):49–56.

13. Assimakopoulos S.F., Karamouzos V., Lefkaditi A., et al. Triple combination therapy with high-dose ampicillin/sulbactam, high-dose tigecycline and colistin in the treatment of ventilator-associated pneumonia caused by pan-drug resistant Acinetobacter baumannii: a case series study. Infez Med. 2019;27(1):11–6.

14. Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю. и др. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Acinetobacter spp. в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН-2013–2014. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2017;19(1):42–8.

15. Skleenova E., Sukhorukova M., Timokhova A.,et al. Sharp increase in carbapenem-non-susceptibility and carbapenemase production rates in nosocomial Gram-negative bacteria in Russia over the last decade. Proceedings of 53rd Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy (ICAAC), 2012,Denver, CO, USA.

16. Мартинович А.А. Динамика антибиотикорезистентности и эпидемиология инфекций, вызванных Acinetobacter spp., в России. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2010;12:96–105.

17. Суворова М.П., Яковлев С.В., Басин Е.Е. и др. Современные рекомендации по антибактериальной терапии нозокомиальной пневмонии в ОРИТ на основании многоцентрового мониторинга возбудителей и резистентности в лечебно-профилактических учреждениях России. Фарматека. 2015;14(307):46–50.

18. Эйдельштейн М.В., Сухорукова М.В., Склеенова Е.Ю. и др. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Pseudomonas aeruginosa в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН 2013–2014. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2017;19(1):37–41.

19. Романов А.В., Дехнич А.В., Сухорукова М.В. и др. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Staphylococcus aureus в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН-2013–2014. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2017;19(1):57–62.

20. Сухорукова М.В., Склеенова Е.Ю., Иванчик Н.В.и др. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Staphylococcus aureus в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН в 2011–2012 гг. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия.2014;16:280–86.

21. Pastuović T., Perić M., Bosnjak Z., et al. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus in North-east Croatia. Acta Med Acad. 2015;44:10–7.

22. Garcia L.S., Isenberg H.D. Clinical microbiology procedures handbook. 3rd ed. 3 Vol. set. Washington, DC: ASM Press; 2010.

23. Определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам. Клинические рекомендации. Версия 2018-03.

24. Романов А.В., Дехнич А.В. Типирование MRSA: какие методы являются оптимальными для решения различных задач? Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2011;13:168–76. [Romanov A.V., Dekhnich A.V.Typing MRSA: which methods are optimal for solving various problems? Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya. 2011;13:168–76.

25. Dunne W.M. Jr, Jaillard M., Rochas O., et al. Microbial genomics and antimicrobial susceptibility testing. Exp Rev Mol Diagn. 2017;17(3):257–69.

26. Ellington M.J., Ekelund O., Aarestrup F.M., et al. The role of whole genome sequencing in antimicrobial susceptibility testing of bacteria: report from the EUCAST Subcommittee. Clin Microbiol Infect. 2017;23(1):2–22. Doi:10.1016/j.cmi.2016.11.012

27. Traczewski M.M., Carretto E., Moore N.M.; eCarba-RStudy Team. Multicenter Evaluation of the Xpert Carba-R Assay for Detection of Carbapenemase Genes in Gram-Negative Isolates. J Clin Microbiol. 2018;56(8):e00272–18.

28. Kim S.Y., Park J.S., Hong Y.J., et al. Microarray-Based Nucleic Acid Assay and MALDI-TOF MS Analysis for the Detection of Gram-Negative Bacteria in Direct Blood Cultures. Am J Clin Pathol. 2019;151(2):143–53.

29. Pardo J., Klinker K.P., Borgert S.J., et al. Clinical and Economic Impact of Antimicrobial Stewardship Interventions With the FilmArray® Blood Culture Identification Panel. Diagn Microbiol Infect Dis. 2016;84(2):159–64. Doi 10.1016/j.diagmicrobio.2015.10.023.

30. Schulte B., Eickmeyer H., Heininger A., et al. Detection of pneumonia associated pathogens using a prototype multiplexed pneumonia test in hospitalized patients with severe pneumonia. PLOS One. 2014;9(11):e11056. Doi: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0110566.

31. Papan C., Meyer-Buehn M., Laniado G., et al. Assessment of the multiplex PCR-based assay Unyvero pneumonia application for detection of bacterial pathogens and antibiotic resistance genes in children and neonates. Infection. 2018;46(2):189–96. DOI: 10.1007/s15010-017-1088-y.

32. Савочкина Ю.А., Александрова И.А., Ершова О.Н.и др. Использование молекулярно-генетических методов в этиологической диагностике бактериальных менингитов у нейрохирургических больных. XVII Международный конгресс по антимикробной терапии 20–22 мая 2015, Москва.

33. Wong Y.-P., Othman S., Lau Y.-L., et al. Loop-mediated isothermal amplification (LAMP): a versatile technique for detection of micro-organisms. J Appl Microbiol. 2018;124(3):626–43. Doi: 10.1111/jam.13647.

34. Barreda-Garcia S., Miranda-Castro R., de-Los-Santos-Alvarez N., et al. Helicase-dependent isothermal amplification: a novel tool in the development of molecular-based analytical systems for rapid pathogen detection. An Bioanal Chem. 2018;410:679–93. Doi: http://dx.doi.org/10.1007/s00216-017-0620-3

35. Li J., Macdonald J., van Stetten F. Review: a comprehensive summary of a decade development of the recombinase polymerase amplification. Analyst. 2019;144:31–67.

36. Mayboroda O., Katakis I., O’Sullivan C.K. Multiplexed isothermal nucleic acid amplification. Anal Biochem. 2018;545:20–30. Doi: https://doi.org/10.1016/j.ab.2018.01.005.


Об авторах / Для корреспонденции


Автор для связи: С.А. Рачина, д.м.н., доцент кафедры клинической фармакологии, Смоленский государственный медицинский университет, Смоленск, Россия; e-mail: svetlana.ratchina@antibiotic.ru
Адрес: 214019, Россия, Смоленск, ул. Крупской, 28


Бионика Медиа